A l'âge de 5 ans, Yuuki perd la mémoire. Elle rencontre un vampire terrifiant qui veut boire son sang alors que la pauvre petite est perdue dans une plaine enneigée.
Heureusement un Vampire de Sang-Pur la sauve: il se nomme Kaname Kuran. Il ramène Yuuki chez un de ses amis, Cross Kaien qui l'adopte de suite...
Dix ans se sont écoulés depuis, Yuuki a maintenant 15 ans.
Yuuki et Zero sont les gardiens de la Cross Academy. Yuuki ne montre pas qu'elle a des sentiments pour Kaname. Ses sentiments pour Zero sont un mélange d'amitié, d'amour et de fraternité. En fait, les préfets de l'Académie doivent protéger un secret : celui de la « Night Class » (ce sont des Vampires).
Kaname et Zéro ne s'aiment pas mais acceptent de se cotoyer par amour pour Yuuki.